論文 - 牛田 千里
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Lack of CeR-2a RNA gene delays egg-laying onset in C. elegans mutant.
Koyama T, Masui T, Uematsu T, Ushida C.
Biochem Biophys Res Commun. 778 2025年09月
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cAMP-CRP-activated E. coli causes growth arrest under stress conditions.
Haque MF, Tarusawa T, Ushida C, Ito S, Himeno H.
Front Microbiol. 2025年08月
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Starvation changes the pre-rRNA accumulations in Caenorhabditis elegans
Shahriar Rahman Shovon, Tomoki Uematsu, Yuki Osaki, Tatsushi Masui, Takashi Koyama, Toshinobu Fujiwara, Chisato Ushida
Biochemical and Biophysical Research Communications 742 2024年12月
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A leaderless mRNA including tRNA-like sequence encodes a small peptide that regulates the expression of GcvB small RNA in Escherichia coli
Akira Muto, Simon Goto, Daisuke Kurita, Chisato Ushida, Akiko Soma, Hyota Himeno
Journal of Biochemistry 2022年01月
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Identification of a short form of a Caenorhabditis elegans Y RNA homolog Cel7 RNA.
Chiba T, Kihara SY, Sato M, Xingkui K, Goto S, Suzumura T, Kawai G, Himeno H, Ushida C
Biochemical and biophysical research communications 557 104 - 109 2021年06月
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Involvement of GcvB small RNA in intrinsic resistance to multiple aminoglycoside antibiotics in Escherichia coli.
Muto A, Goto S, Kurita D, Ushida C, Himeno H
Journal of biochemistry 169 ( 4 ) 485 - 489 2021年04月
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Methiin as a nematode attractant in Allium sativum
Noboru Takada, Sayaka Sutoh, Masuru Toyota, Yoshihisa Yamazaki, Nozomi Kitano-Yamashita, Chisato Ushida, Kazuo Yamashita
Canadian Journal of Chemistry 98 ( 3 ) 164 - 168 2020年01月
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Nuclear localization of a C. elegans CCCH-type zinc finger protein encoded by T26A8.4
Takashi Koyama, Chisato Ushida
microPublication Biology 2018 2018年09月
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Sequence and structure analysis of a mirror tRNA located upstream of the cytochrome oxidase I mRNA in mouse mitochondria.
Saya Okui, Chisato Ushida, Hidenori Kiyosawa, Gota Kawai
Journal of Biochemistry 159 ( 3 ) 341 - 350 2016年03月
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(p)ppGpp-dependent and -independent pathways for salt tolerance in Escherichia coli.
Takefusa Tarusawa, Shion Ito, Simon Goto, Chisato Ushida, Akira Muto, Hyouta Himeno
Journal of Biochemistry 2016年01月
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Secondary structure-based analysis of mouse brain small RNA sequences obtained by using next-generation sequencing.
Hidenori Kiyosawa, Akio Okumura, Saya Okui, Chisato Ushida, Gota Kawai
Genomics 106 ( 2 ) 122 - 128 2015年08月
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small structured ncRNAの機能ゲノミクス
牛田千里
日本マイコプラズマ学会雑誌 ( 41 ) 15 - 18 2014年12月
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A model of the intracellular response of an olfactory neuron in Caenorhabditis elegans to odor stimulation.
Usuyama, M., Ushida, C., Shingai, R.
PLoS One 7 e42907 2012年08月
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特集 細胞核-構造と機能 4.核小体 Small subunit processome
牛田 千里, 藤原 俊伸
生体の科学 62 ( 5 ) 418 - 419 2011年10月
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特集 細胞核-構造と機能 4.核小体 核小体タンパク質フィブリラリン
牛田 千里, 藤原 俊伸
生体の科学 62 ( 5 ) 420 - 421 2011年10月
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A small nucleolar RNA functions in rRNA processing in Caenorhabditis elegans.
Hokii Y, Sasano Y, Sato M, Sakamoto H, Sakata K, Shingai R, Taneda A, Oka S, Himeno H, Muto A, Fujiwara T, Ushida C
Nucleic acids research 38 ( 17 ) 5909 - 18 2010年09月
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Trans-translation is involved in the CcpA-dependent tagging and degradation of TreP in Bacillus subtilis.
Ujiie H, Matsutani T, Tomatsu H, Fujihara A, Ushida C, Miwa Y, Fujita Y, Himeno H, Muto A
Journal of biochemistry 145 ( 1 ) 59 - 66 2009年01月
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tmRNA-dependent trans-translation is required for sporulation in Bacillus subtilis.
Abe, T., Sakaki, K., Fujihara, A., Ujiie, H., Ushida, C., Himeno, H., Sato, T., Muto, A.
Molecular Microbiology 69 1491 - 1498 2008年09月
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Distribution of U3 small nucleolar RNA and fibrillarin during early embryogenesis in Caenorhabditis elegans.
Sasano, Y., Hokii, Y., Inoue, K., Sakamoto, H., Ushida, C., Fujiwara, T.
Biochimie 90 898 - 907 2008年06月
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Twelve novel C. elegans RNA candidates isolated by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis.
Hokii Y, Kubo A, Ogasawara T, Nogi Y, Taneda A, Arai R, Muto A, Ushida C
Gene 365 83 - 7 2006年01月
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A novel GTPase activated by the small subunit of ribosome.（共著）
Himeno, H., Hanawa-Suetsugu, K., Kimura, T., Takagi, K., Sugiyama, W., Shirata, S., Mikami, T., Odagiri, F., Osanai, Y., Watanabe, D., Goto, S., Kalachnyuk, L., Ushida, C., Muto, A.
Nucleic Acids Research 32 5303 - 5309 2004年10月
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Isolation of eight novel Caenorhabditis elegans small RNAs.（共著）
Wachi, M., Ogawa, T., Yokoyama, K., Hokii, Y., Shimoyama, M., Muto, A., Ushida, C.
Gene 335 47 - 56 2004年03月
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線虫の非翻訳RNA
牛田 千里
細胞工学 23巻10号 1186 - 1192 2004年
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M. capricolum subsp. capricolum California kid株とGM262G株におけるMCS4 RNA遺伝子のマッピング（共著）
牛田千里，宮田真人，ユラテ・シュグザイテ，武藤 昱
日本マイコプラズマ学会雑誌 ( 30 ) 36 - 37 2003年10月
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Distribution of the MCS4 RNA genes in mycoplasmas belonging to the Mycoplasma mycoides cluster. （共著）
Ushida, C., Yoshida, A., Miyakawa, Y., Ara, Y., Muto, A.
Gene 314 149 - 155 2003年05月
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Central region of the human splicing factor Hprp3p interacts with Hprp4p.
Gonzalez-Santos JM, Wang A, Jones J, Ushida C, Liu J, Hu J
The Journal of biological chemistry 277 ( 26 ) 23764 - 72 2002年06月
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Mycoplasma capricolum MCS4 RNA 結合因子MCS4BE2のアスパラギニルtRNA合成酵素活性の測定
横山 幹太朗, 笹木 哲治, 安藤 候平, 松田 貴意, 牛田 千里, 武藤 あきら
日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese Journal of Mycoplasmology 27 70 - 71 2000年12月
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Mycoplasma capricolum MCS4 RNA の種特異性と結合タンパク質
牛田 千里, 安藤 候平, 松田 貴意, 武藤 晃
日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese Journal of Mycoplasmology 26 15 - 17 1999年12月
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Mycoplasma capricolum MCS4 RNA 特異的結合因子の解析
安藤 候平, 松田 貴意, 牛田 千里, 武藤 晃
日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese Journal of Mycoplasmology 25 88 - 90 1998年12月
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Mycoplasma capricolum の低分子RNA
牛田 千里, 笹木 哲治, 安藤 候平, 松田 貴意, 武藤 [アキラ]
日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese Journal of Mycoplasmology 24 18 - 21 1997年12月
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Probing the Secondary Structure of MCS4 RNA of Mycoplasma capricolun
USHIDA Chisato, SASAMURA Shinpei, MUTO Akira
The Journal of Biochemistry 122 ( 6 ) 1202 - 1207 1997年12月
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Mycoplasma capricolum の低分子RNA
牛田 千里, 笹木 哲治, 石井 和由, 上野 晃生, 西田 貴子, 武藤 [アキラ]
日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese Journal of Mycoplasmology 23 78 - 81 1996年12月
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10Sa RNAリボソームの相互作用
只木 敏雅, 姫野 俵太, 福島 雅昭, 佐藤 正和, 牛田 千里, 武藤 〓
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 473 1996年08月
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枯草菌10Sa RNA機能の遺伝的解析
松野 潤, 葛西 七重, 西田 貴子, 牛田 千里, 姫野 俵太, 武藤 〓
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 473 1996年08月
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mRNAとtRNAの機能を持つRNA(10Sa RNA)について
佐藤 正和, 姫野 俵太, 只木 敏雅, 福島 雅昭, 牛田 千里, 武藤 〓
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 472 1996年08月
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マイコプラズマの低分子RNAの検索
牛田 千里, 武藤 [アキラ]
日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese Journal of Mycoplasmology 21 13 - 14 1995年10月